Fase 1 er andre generasjon Saab 9-3 slik den så ut fra lanseringen høsten 2002 frem til ansiktsløftningen i 2007, altså årsmodell 2003–2007. Bilen var bygget på GMs Epsilon-plattform, den samme som Opel Vectra.^{[1, 2, 3]}

Den største endringen fra første generasjon var at kombikupeen forsvant. Den nye 9-3 kom først bare som firedørs sedan, kalt Sport Sedan.^{[1, 2, 4]} Totallengden var den samme som før, men akselavstanden var lengre og bilen bredere.^{[5, 6]}

Saabs egne H-motorer ble erstattet av nye firesylindrede turbomotorer på 2,0 liter i aluminium fra GMs Ecotec-familie.^{[1, 2, 5]} Også 1.8t hadde totalitersmotor. Betegnelsen viste til lavere turbotrykk, ikke mindre slagvolum.^{[1, 2]}

Alle fase 1-biler hadde forhjulsdrift.^{[1, 2]} Cabriolet og stasjonsvognen SportCombi kom etter hvert, og fra 2006 fikk Aero en turboladet V6.^{[1, 2, 3]}

Sikkerhet og understell

Forsetene hadde andre generasjon av Saabs aktive nakkestøtter, SAHR II. De beveger seg frem ved påkjørsel bakfra og skal redusere nakkeslengskader.^{[1, 5]}

Bakakselen var en firelenkeaksel med ReAxs, en passiv bakhjulsstyring. Bakhjulene endrer spissingen litt i svinger, noe som demper understyring.^{[5, 12, 13]} Ved kraftig bremsing spisser bakhjulene litt innover, noe som også demper understyring.^{[1, 13]}

Aero V6

Fra årsmodell 2006 fikk Aero en turboladet 2,8-liters V6 på 250 hk.^{[1, 2, 8]} Motoren hadde twin-scroll-turbo.^{[2, 14]}